Scripts lentos são, normalmente, partes de seu site/aplicação que possuem elevado tempo de execução, gerando lentidão no acesso.
A internet melhora a cada dia, o seu site também!
É sempre importante ter uma manutenção efetiva no seu site otimizações no código dos scripts, pois o tempo da sua execução é relacionado às funções usadas e a todos os dados envolvidos (banco de dados, redimensionamento de imagens, conexões externas como twitter, pagseguro, etc) além de afetar o uso de recursos do servidor.
Isto impacta diretamente na quantidade de acessos simultâneos que seu site poderá receber e pode ser responsável por lentidões pontuais em função de estouro da pool de recursos destinadas ao site.